در مستند کاوش در اعماق اقیانوس‌ها، به کمک ادغام داده‌های علمی، بازسازی دیجیتال حملات کشتی‌ها، گنجینه‌ها و شهرهای زیرزمینی دریاچه‌ها، دریاها و اقیانوس‌های سراسر جهان دوباره زنده می‌شوند. تکنولوژی نوآورانه به بینندگان اجازه می‌دهد تا ببینند که چه چیزهایی در کف آب‌های عظیمی مانند خلیج مکزیک، نیل، اقیانوس هند، دریای بالتیک و اقیانوس اطلس قرار دارند، به شرط اینکه آنها تخلیه شده باشند. سپس تلاش می‌شود تا شگفتی‌های طبیعی و فاجعه‌های ساختگی، داستان‌هایی در مورد چگونگی انقراض کشتی‌ها و چگونگی شکل‌گیری سازه‌های زمین شناسی باستانی که زندگی را شکل داده‌اند، توضیح داده شوند و به این سوال پاسخ داده شود که چرا بسیاری همچنان به دنبال شهر‌افسانه ای آتلانتیس هستند.